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Bauer, H.-G.; Helm, B.: Verteilung, Häufigkeit und Wertigkeit der Brutvogelarten im Hinblick auf den potenziellen Ausbau des Universitätsgeländes in Konstanz-Egg. Gutachten für die Planungsbüros “365°” und “Senner” (2010)

Quillfeldt, P.; Bauer, H.-G.; Matuszak, A.: Waterbirds as important top consumers at Lake Constance – Dietary segregation and energy flow. Abschlussbericht, SFB-Projekt A8, Universität Konstanz, Konstanz (2010)

Bauer, H.-G.: Wasservogelerfassungen in Baden-Württemberg - Datenlage, bisherige Kenntnisse im Hinblick auf das Virengeschehen sowie Neuausrichtung, Professionalisierung und Ausweitung des Monitoringprogramms auf alle Landesteile. Forschungsbericht im Rahmen des WuV-Projektes. Für MLR, Stuttgart (2009), 126 pp.

Bauer, H.-G.: Wasservogelerfassungen in Baden-Württemberg. Forschungsbericht im Rahmen des WuV-Projektes. Für MLR, Stuttgart (2008)

Bauer, H.-G.: Gutachten zur Frage von Kormoranvergrämungen im NSG Radolfzeller Aachried. Für RP und MLR, Stuttgart (2008)

Ingram, J.; Cowx, I. G.; Bauer, H.-G.: Evaluation Report on COST Action 635 INTERCAFE-Conserving Biodiversity. Bericht für COST Domain Committee, Brüssel (2008)

Bauer, H.-G.; Heine, G.: Bodensee-Brutvogelatlas 2000. (2006)

Bauer, H.-G.; Ley, H.-W.: Bewertung der gutachterlichen Voreinschätzung zum Bau von Windkraftanlagen bei Hüfingen. Gutachten für Landratsamt Schwarzwald-Baar-Kreis (2005)

Tutin, C.; Stokes, E.; Boesch, C.; Morgan, D.; Sanz, C.; Reed, T.; Blom, A.; Walsh, P.; Blake, S.; Kormos, R.: Regional action plan for the conservation of chimpanzees and gorillas in western equatorial Africa. CABS/CI, Washington DC (2005)

Bauer, H.-G.; Berthold, P.; Boye, P.; Knief, W.; Südbeck, P.; Witt, K.: Liste der Brutvogelarten Deutschlands mit Bestands- und Trendangaben für 1989-1999. (2004)

Peintinger, M.; Fiedler, W.; Bauer, H.-G.: Auswirkung veränderter Klimafaktoren auf Verbreitung, Zug- und Brutverhalten von Vögeln in Südwestdeutschlands. Gutachten für LfU, Karlsruhe (2004)

Blake, S.; Bouché, P.; Rasmussen, H.; Orlando, A.; Douglas-Hamilton, I.: The last Sahelian elephants: Ranging behavior, population status and recent history of the desert elephants of Mali. (2003)

Schmidt, D.; Bauer, H.-G.: Fortführung und Optimierung des Brutvogelmonitoring Baden-Württembergs - Neukonzeption. Forschungsbericht für LfU, Karlsruhe (2002)

Stark, H.; Jacoby, H.; Mörtl, M.; Schmieder, K.; Werner, S.; Bauer, H.-G.: Untersuchungen zum Beziehungsgefüge zwischen den Wasservögeln als Hauptkonsumenten am Bodensee und der Primär- und Sekundärproduktion bzw den trophischen Änderungen über die Zeit. Forschungsbericht für ISF, Langenargen und LfU, Karlsruhe (2002), 69 pp.

Bauer, H.-G.; Ley, H.-W.: Untersuchungen zur Vogelschlag-Problematik an Glasfassaden - im Zusammenhang mit der Errichtung eines Thermal- und Erlebnisbades mit Gesundheitszentrum ("Colani-Therme") in Friedrichshafen-Fischbach. Gutachten für Stadt Friedrichshafen, Friedrichshafen (2001)

Koffijberg, K.; Bauer, H.-G.; Boschert, M.; Delacour, G.; Dronneau, C.; Keller, V.; Sudfeldt, C.: Waterbirds in the Rhine Valley in 1999/2000 with a summary of trends in 1998-2000. (2001), 112 pp.

Bauer, H.-G.: Feststellung der Vogelverluste durch Stromtod an Mittelspannungsleitungen (>1kV) und Oberleitungen der Deutschen Bahn AG. Gutachten für BfN, Bonn (2000)

Bauer, H.-G.; Stark, H.: Die Bedeutung der Wasservögel für das Ökosystem und den Stoffhaushalt von Seen. Gutachten für Institut für Seenforschung, Langenargen (1999)

Hermann, G.; Trautner, J.; Schettler, W.; Eberhardt, M.; Bauer, H.-G.: Verträglichkeitsstudie gemäß §19 Bundesnaturschutzgesetz im Hinblick auf FFH und Vogelschutzrichtlinie zum Betrieb der direkten Schiffsverbindung Konstanz-Friedrichshafen. Für Katamaran-Reederei Bodensee (1999)

Werner, M.; Bauer, H.-G.: Zur Situation wandernder Vogelarten in Deutschland - Konzeption für einen Zug- und Rastvogelatlas. Bericht für Staatliche Vogelschutzwarte Hessen und Dachverband Deutscher Avifaunisten (1999)

Bauer, H.-G.; Boschert, M.: Artenschutzprogramm Baden-Württemberg. Artenschutzkonzept Schwarzhalstaucher (Podiceps nigricollis). Bericht für LfU, Karlsruhe (1998)

Bauer, H.-G.; Boschert, M.: Artenschutzprogramm Baden-Württemberg. Artenschutzkonzept Krickente (Anas crecca). Bericht für LfU, Karlsruhe (1998)

Bauer, H.-G.; Stark, H.; Boschert, M.: Artenschutzprogramm Baden-Württemberg. Artenschutzkonzept Flußseeschwalbe (Sterna hirundo). Bericht für LfU, Karlsruhe (1998)

Boschert, M.; Bauer, H.-G.: Artenschutzprogramm Baden-Württemberg. Jahresendbericht für: Schwarzhalstaucher, Krickente, Kormoran und Rohrdommel. Bericht für LfU, Karlsruhe (1998)

Aguilar-Armat, J. A.; Aguilar Delgado, F. J.; Alcalá-Zamora Barrón, A.; Asensio, B.; Ayala Moreno, J. M.; Alon, D.; Aydemir, G.; Bauer, H.-G.; Benaïssa, Z.; van den Berk, V. et al.; Boukhalfa, D.; Criado, J.; Crockford, N. J.; Dakki, M.; Dändliker, G.; Engblom, G.; Fernández-Galiano, E.; Fox, A.; Franchimont, J.; Garrido, H.; Gorban, I.; Hamrouni, H.; Handrinos, G.; Heredia, B.; Holmes, J.; Hunter, J.; Iankov, P.; Ivanov, B.; Jerrentrup, H.; Jiménez, J.; Khan, A.; Kirwan, G.; López Martos, J. M.; Máñez, M.; Martí, R.; Matamala, J. J.; Mayol, J.; Moreno Arroyo, B.; Morillo, C.; Munteanu, D.; Nevado, J. C.; Nielsen, O. K.; Opitz, H.; Pereira, P.; Patrikeev, M.; Quero Fernández de Molina, J.; Rose, P.; Shy, E.; Torres Esquivias, J. A.; Urdiales, C.; Vitaloni, M.; Yarar, M.: Action plan for the White-headed Duck (Oxyura leucocephala) in Europe. Technical Report, WWT. (1996)

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Kipson, M.; Herrando, S.; Bauer, H.-G.: Caucasus regional meeting - Strengthening the network and developing a strategy to fill in the gaps, (2016)

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Hofer, S. B.; Mrsic-Flogel, T. D.; Bonhoeffer, T.; Hübener, M.: Plasticity in mouse visual cortex after monocular deprivation revealed by optical imaging, (2004)

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Zhang, J.; Gill, P.; Gallant, J.; Theunissen, F. E.: STRFPAK (Version 5.3). Software for estimating Spatio-Temporal Receptive Fields of sensory neurons, (2003)

Schlenker, R.: Vogelbücher der Schweiz aus fünf Jahrhunderten. Textblatt zur Ausstellung in der Stiftsbibliothek des Benediktinerklosters Einsiedeln (Exkursion vom 6. Oktober 2001 anläßlich der 134. Jahresversammlung der Deutschen Ornithologen-Gesellschaft in Schwyz), (2001)

Eibl-Eibesfeldt, I.: Der Glaube an die Globalisierung. Interviewserie mit Hannes Dichand, Kronenzeitung: 1.10.2000, S. 28-29; 2.10.2000, S. 20; 3.10.2000, S. 23; 4.10.2000, S. 32; 5.10.2000, S.27, (2000)

Eibl-Eibesfeldt, I.: Paradies der Echsen und Schildkröten, SZ am Wochenende, p. 1 (1998)

Eibl-Eibesfeldt, I.: Eine bedrohte Arche Noah im Pazifik. Interview mit dem Verhaltensforscher Prof. I. Eibl-Eibesfeldt über die Situation der Galápagos-Inseln, Berliner Morgenpost, p. 30 - 30 (1997)

Eibl-Eibesfeldt, I.; Schiefenhövel, W.: Motukwe-Unsere Regenwelt. Eipo im zentralen Hochland von West-Neuguinea (Irian Jaya). Begleitveröffentlichung zum Film P 2319 des ÖWF, Wissenschaftlicher Film 48-49, pp. 119 - 158 (1997)

Eibl-Eibesfeldt, I.: Eipo (West-Neuguinea, Zentrales Hochland). Männertanz "sang mote". Wissenschaftlicher Film E 2685, Publikationen zu Wissenschaftlichen Filmen 9, pp. 113 - 126 (1996)